En 1,986 el Pastor General de la Fráter el Doctor Jorge H. López, junto a su esposa la Dra. Elsy de López creen en la visión de proveer a las familias cristianas evangélicas un establecimiento educativo con una formación educativa uniendo en un mismo sentir en Cristo a los hogares, el colegio e iglesia, nace entonces, el Liceo Fráter en las instalaciones de La Fráter Roosevelt en lo que en ese momento se conocía como la casa patronal y con mucho entusiasmo, trabajo, diligencia y excelencia; el Liceo Fráter se convierte en uno de los primeros colegios en brindar tecnología de punta y el manejo del idioma inglés como un segundo idioma, dándole a sus alumnos las herramientas necesarias para desenvolverse en la sociedad. Así es como en 1,998 gradúa a 18 jóvenes bachilleres en ciencias y letras con orientación en computación. 36 años han pasado desde su fundación y en su historia cuenta con 25 promociones de Bachilleres en Ciencias y Letras con Orientación en Computación y 15 promociones de Bachilleres en Ciencias y Letras graduadas y preparadas para ser líderes de impacto en la sociedad que se alcancen el éxito terrenal y lo consagren al propósito celestial.
En el año 2017 se funda el Liceo Fráter San Cristóbal como una multiplicación de la misma visión y misión y como 36 años atrás se hizo; inicia una nueva historia con los niveles de preprimaria y primaria para posteriormente continuar con nivel medio, en la actualidad se cuenta con los tres niveles y tres promociones graduadas de Bachilleres en Ciencias y Letras en el 2022
